El 15 de junio de 1924, fiesta de la Santísima Trinidad, se menciona en la “Letras de Erección del Seminario Diocesano” el anhelo ferviente de instituir un Seminario propio, lo que fue posible gracias a las plegarias de donativos de la comunidad cristiana. Nació así, bajo el amparo de Nuestra Señor de Itatí, con escasos recursos materiales pero con plena confianza en el auxilio de Dios, el Seminario Diocesano de corrientes, instituyéndose en sus comienzos en el edificio del Santuario de Itatí, sujeto a lo establecido en el Concilio de Trento, Código de Derecho Canónico y Decretos del Concilio Plenario de la América Latina.

Su objetivo era la formación del Clero propio donde la educación moral domine la formación de los alumnos. En cuanto a la instrucción científica se ajustó al Plan de Estudios del Papa Pío X y a las necesidades de nuestra Iglesia y sus fieles.

Según lo establecido en las Constituciones del Seminario Diocesano de Corrientes, la Dirección corresponde al Obispo, quien tiene el derecho exclusivo de nombrar y destituir las autoridades internas y, de acuerdo, el Rector, son subalternas.

El Rector, encargado de la dirección interina, es ayudado por un Prefecto General en la parte disciplinaria, en lo científico por los profesores, en la administración por el ecónomo y en la Piedad, por el Director Espiritual (en la actualidad, por primera vez, el Seminario solo cuenta con Rector).

La fiesta de Erección Canónica se realizó el 17 de julio de 1924 en el Templo, con la Imagen gloriosa de María presidiendo en acto.

El presbiterio ocupado por el Sr. Obispo , monseñor Luis María Niella, rodeado por los alumnos, personal directivo y docentes del Seminario y el Templo repleto de fieles.

Posteriormente, viendo el crecimiento de la Iglesia de Corrientes, monseñor Francisco Vicentín aunó esfuerzos con el clero para concretar un sueño, formar sus propios sacerdotes, lo que a su vez favorecería la formación del Seminarista, teniendo en cuenta el ámbito socio-cultural, el contacto con la familia y la propia realidad eclesial en la que posteriormente servirían.

Dicho sueño comenzó a concretarse el 1° de julio de 1939 con la colocación de la Piedra Fundamental, en al rivera del caudaloso Río Paraná, en un predio de 6 hectáreas comprendido entre las calles Quintana, Chacabuco y Estados Unidos.

Al año siguiente, el día 13 de abril de 1940, se inaugura la Planta Baja del Seminario con lo cual comienza su actividad. Se estableció como Patrono de la Capilla del Establecimiento al Sagrado Corazón de Jesús, y como titular de la casa a la Virgen de Itatí. Para el año 1942, al completarse la ampliación del edificio, habilitándose dos dormitorios, albergaba a su sombra un número apreciable de aspirantes al sacerdocio.

En sus inicios los seminaristas cursaban sus estudios en una Institución Salesiana, hasta que por Decreto 4093/64 se reconoce y aprueba el Ciclo Básico y Bachillerato Común. Por el año 1982, por Resolución 218/82 se modificó el Plan de estudios del Bachillerato y por Decreto 2785/85 se incorpora al presupuesto del Ministerio de Hacienda y Finanzas de la Provincia.

En el año 1998 se comienza a implementar en forma paulatina y progresiva la Ley Federal de Educación 24195 con la apertura del Tercer Ciclo de la Educación General Básica según Resolución Ministerial 321/98.

Con la transformación educativa propuesta por la Nueva Ley, el Seminario preocupado por la situación social del país y la vida cristiana, previo análisis y consulta, decide ampliar su servicio educativo a alumnos externos no seminaristas, conviviendo, a partir de entonces el régimen de alumnos seminaristas y alumnos varones para familias cristianas.

Este proceso de transformación nos comprende a implementar a partir de 2002 el Nivel Polimodal con Orientación en Humanidades y Ciencias Sociales, que sería la Modalidad y la razón de ser del Seminario Arquidiocesano “Nuestra Señora de Itatí” I.S.2.

Con la apertura a los alumnos no seminaristas, cada año fue mayor la población escolar y las problemáticas surgidas a raíz de confusiones debido a que con el mismo nombre funcionaban dos instituciones: el Seminario con jóvenes seminaristas con inquietudes vocacionales hacia la vida sacerdotal; por otro, el Seminario como Institución de Educación Oficial de Gestión privada donde pueden asistir alumnos que estén de acuerdo con los objetivos y respeten el Ideario Institucional.

Fue así, que a partir del año lectivo 2005 el Seminario se ha desdoblado, conservando el nombre de Seminario Menor Arquidiocesano “Nuestra Señora de Itatí”.

Para la tarea formadora de futuros sacerdotes y actividades pastorales eclesiales, y como Instituto Privado Católico “Nuestra Señora de Itatí” I.S.2, como Instituto de Educación Oficial de Gestión Privada de la Provincia de Corrientes.